Các contigs được lắp ráp thành giàn giáo như thế nào?
Các contigs được lắp ráp thành giàn giáo như thế nào?

Video: Các contigs được lắp ráp thành giàn giáo như thế nào?

Video: Các contigs được lắp ráp thành giàn giáo như thế nào?
Video: Khoá học Laravel Framework 8.x - Bài 6: Controller trong Laravel 8.x 2024, Tháng mười hai
Anonim

Khi tạo ra một bộ gen dự thảo, các lần đọc DNA cá nhân trước tiên là lắp ráp thành contigs , mà theo bản chất của cuộc họp , có khoảng cách giữa chúng. Bước tiếp theo là đến sau đó thu hẹp khoảng cách giữa những liên quan đến tạo một khung . Điều này có thể được thực hiện bằng cách sử dụng ánh xạ quang học hoặc giải trình tự cặp giao phối.

Tương tự, bạn có thể hỏi, contigs và giàn giáo là gì?

MỘT khung là một phần của trình tự bộ gen được tái tạo từ các bản sao shotgun toàn bộ bộ gen đã được giải trình tự cuối. Giàn che được hình thành bởi đường viền và những khoảng trống. MỘT khuôn khổ là độ dài liền kề của trình tự gen trong đó thứ tự của các cơ sở được biết đến với mức độ tin cậy cao. Trong vài trường hợp, giàn giáo có thể chồng lên nhau.

Ngoài ra, contigs trong tin sinh học là gì? MỘT khuôn khổ (từ tiếp giáp) là một tập hợp các đoạn DNA chồng chéo lên nhau đại diện cho một vùng đồng thuận của DNA. Contigs do đó có thể đề cập đến cả trình tự DNA chồng chéo và các phân đoạn vật chất chồng chéo (các đoạn) được chứa trong các dòng vô tính tùy thuộc vào ngữ cảnh.

Về vấn đề này, các contigs được lắp ráp như thế nào?

Tập hợp của trình tự DNA chồng chéo của các đoạn DNA được gọi là khuôn khổ . Contig ánh xạ là một quá trình mà các bản sao chồng chéo lắp ráp để xâu chuỗi sự chồng chéo đó. Điều này liên quan đến việc sắp xếp đường viền theo thứ tự và định hướng. Dòng vô tính đường viền có thể tự động lắp ráp bằng cách sử dụng trình tự kết thúc BAC của chúng.

Tại sao contigs lại quan trọng?

Contig lắp ráp là một quan trọng bước lắp ráp bộ gen. Để lập bản đồ, các bản sao chồng chéo được tập hợp để sắp xếp chồng chéo. Mỗi đoạn được nhân bản trong một vector và được giải trình tự từ cả hai đầu để tạo ra độ dài trình tự khoảng 600–700 bp. Trình tự từ cả hai đầu của đoạn DNA được gọi là kết thúc cặp.

Đề xuất: